MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015561	CCCG	2	8	90112	90119	0 %	0 %	25 %	75 %	333917657
2002	NC_015561	CGA	2	6	90144	90149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917657
2003	NC_015561	CTC	2	6	90205	90210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917657
2004	NC_015561	GAC	2	6	90223	90228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917657
2005	NC_015561	AGC	2	6	90229	90234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917657
2006	NC_015561	GGC	2	6	90235	90240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917657
2007	NC_015561	CGA	2	6	90318	90323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917657
2008	NC_015561	TCG	3	9	90359	90367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917657
2009	NC_015561	AC	3	6	90422	90427	50 %	0 %	0 %	50 %	333917657
2010	NC_015561	CA	3	6	90445	90450	50 %	0 %	0 %	50 %	333917657
2011	NC_015561	TGA	2	6	90453	90458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917657
2012	NC_015561	GGC	2	6	90551	90556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917657
2013	NC_015561	GCA	2	6	90619	90624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917658
2014	NC_015561	GAAG	2	8	90755	90762	50 %	0 %	50 %	0 %	333917658
2015	NC_015561	GCG	2	6	90799	90804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917658
2016	NC_015561	CACCGA	2	12	90845	90856	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917658
2017	NC_015561	GCG	2	6	90875	90880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917658
2018	NC_015561	CAT	2	6	90929	90934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917658
2019	NC_015561	CAA	2	6	91040	91045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917658
2020	NC_015561	CAA	2	6	91090	91095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917658
2021	NC_015561	CAT	2	6	91161	91166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917658
2022	NC_015561	GCT	2	6	91184	91189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917658
2023	NC_015561	AAG	2	6	91221	91226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917658
2024	NC_015561	GCC	2	6	91326	91331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_015561	AGC	2	6	91424	91429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2026	NC_015561	GCT	2	6	91507	91512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2027	NC_015561	GTT	2	6	91601	91606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917659
2028	NC_015561	TCG	2	6	91627	91632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2029	NC_015561	ACC	2	6	91650	91655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917659
2030	NC_015561	TGC	2	6	91658	91663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2031	NC_015561	GCT	2	6	91674	91679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2032	NC_015561	AGC	2	6	91683	91688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917659
2033	NC_015561	ACT	2	6	91764	91769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917659
2034	NC_015561	TCC	2	6	91855	91860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917659
2035	NC_015561	GTA	2	6	91918	91923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917660
2036	NC_015561	GCT	2	6	92048	92053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917660
2037	NC_015561	CG	3	6	92059	92064	0 %	0 %	50 %	50 %	333917660
2038	NC_015561	GCT	2	6	92081	92086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917660
2039	NC_015561	TCA	2	6	92117	92122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917660
2040	NC_015561	CGG	2	6	92196	92201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917660
2041	NC_015561	GGC	2	6	92272	92277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917660
2042	NC_015561	TGC	2	6	92410	92415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917660
2043	NC_015561	GGTC	2	8	92511	92518	0 %	25 %	50 %	25 %	333917660
2044	NC_015561	CTT	2	6	92548	92553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917660
2045	NC_015561	TCC	2	6	92624	92629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_015561	TGCC	2	8	92791	92798	0 %	25 %	25 %	50 %	333917661
2047	NC_015561	CAG	2	6	92840	92845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917661
2048	NC_015561	GC	3	6	92847	92852	0 %	0 %	50 %	50 %	333917661
2049	NC_015561	GC	3	6	92854	92859	0 %	0 %	50 %	50 %	333917661
2050	NC_015561	CCA	2	6	92965	92970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917661
2051	NC_015561	TGTC	2	8	92983	92990	0 %	50 %	25 %	25 %	333917661
2052	NC_015561	GT	3	6	93053	93058	0 %	50 %	50 %	0 %	333917661
2053	NC_015561	GTT	2	6	93071	93076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917661
2054	NC_015561	TTG	2	6	93098	93103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917661
2055	NC_015561	GTA	2	6	93172	93177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917661
2056	NC_015561	CAA	2	6	93205	93210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917661
2057	NC_015561	TGC	2	6	93236	93241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917661
2058	NC_015561	GGT	2	6	93284	93289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917661
2059	NC_015561	AGC	2	6	93357	93362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917661
2060	NC_015561	CGA	2	6	93457	93462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_015561	CAA	2	6	93749	93754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_015561	ACGAG	2	10	93767	93776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2063	NC_015561	TAT	2	6	93928	93933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_015561	CAG	2	6	94005	94010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917662
2065	NC_015561	CTC	2	6	94039	94044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917662
2066	NC_015561	CGGC	2	8	94089	94096	0 %	0 %	50 %	50 %	333917662
2067	NC_015561	CGA	2	6	94170	94175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917662
2068	NC_015561	CGA	2	6	94191	94196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917662
2069	NC_015561	AGA	2	6	94288	94293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917663
2070	NC_015561	ACT	2	6	94313	94318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917663
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2072	NC_015561	CAT	2	6	94436	94441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917663
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2074	NC_015561	CAT	2	6	94484	94489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917663
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2077	NC_015561	CG	3	6	94557	94562	0 %	0 %	50 %	50 %	333917663
2078	NC_015561	CCA	2	6	94585	94590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917663
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2081	NC_015561	GA	3	6	94655	94660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_015561	GTT	2	6	94857	94862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2083	NC_015561	GGGT	2	8	94902	94909	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2085	NC_015561	GGTGA	2	10	95087	95096	20 %	20 %	60 %	0 %	333917664
2086	NC_015561	GTT	2	6	95152	95157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917664
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2089	NC_015561	CAC	2	6	95191	95196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
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2092	NC_015561	GAA	2	6	95281	95286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917664
2093	NC_015561	GCC	2	6	95294	95299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917664
2094	NC_015561	CGG	2	6	95309	95314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917664
2095	NC_015561	CG	3	6	95356	95361	0 %	0 %	50 %	50 %	333917664
2096	NC_015561	TCG	2	6	95402	95407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917664
2097	NC_015561	CGCC	2	8	95431	95438	0 %	0 %	25 %	75 %	333917664
2098	NC_015561	CAC	2	6	95480	95485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
2099	NC_015561	ATC	2	6	95528	95533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917664
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2106	NC_015561	CAG	2	6	95899	95904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917664
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2109	NC_015561	TGT	2	6	95948	95953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917664
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2111	NC_015561	GCT	2	6	95979	95984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917664
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2113	NC_015561	ATC	2	6	96013	96018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917664
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2115	NC_015561	GCG	2	6	96122	96127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_015561	GTCT	2	8	96138	96145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_015561	CAG	2	6	96230	96235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
2118	NC_015561	ACCT	2	8	96237	96244	25 %	25 %	0 %	50 %	333917665
2119	NC_015561	CGT	2	6	96272	96277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
2120	NC_015561	CCCGA	2	10	96327	96336	20 %	0 %	20 %	60 %	333917665
2121	NC_015561	CGA	2	6	96401	96406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
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2123	NC_015561	TGGC	2	8	96417	96424	0 %	25 %	50 %	25 %	333917665
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2125	NC_015561	CGG	2	6	96449	96454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917665
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2242	NC_015561	TTTAC	2	10	102059	102068	20 %	60 %	0 %	20 %	333917673
2243	NC_015561	CA	3	6	102074	102079	50 %	0 %	0 %	50 %	333917673
2244	NC_015561	CATT	2	8	102181	102188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2245	NC_015561	CTG	2	6	102215	102220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.